More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4412 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4412  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
367 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0884  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.61 
 
 
367 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0972  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.32 
 
 
369 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1173  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  80.87 
 
 
367 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.33 
 
 
367 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4680  oxidoreductase  80.94 
 
 
370 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53400  oxidoreductase  81.22 
 
 
370 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.31 
 
 
370 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2070  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.04 
 
 
374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3097  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.93 
 
 
367 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432151  normal  0.23226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1928  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.68 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02130  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family protein  58.86 
 
 
365 aa  428  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1135  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.62 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0661889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3391  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.76 
 
 
363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.29 
 
 
374 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0436384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.24 
 
 
367 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.0297494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2707  putative oxidoreductase  54.84 
 
 
372 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.59 
 
 
368 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.334271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3439  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.32 
 
 
366 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0406349  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1268  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.39 
 
 
371 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0160368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1461  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.32 
 
 
366 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.548376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.15 
 
 
370 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.23 
 
 
378 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.53 
 
 
363 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.37113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.01 
 
 
385 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.25 
 
 
372 aa  359  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582883  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.49 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.08 
 
 
370 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.34 
 
 
380 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.71 
 
 
363 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.71 
 
 
363 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.71 
 
 
363 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6910  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.5 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.55 
 
 
384 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.105187  hitchhiker  0.000875801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.63 
 
 
375 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.24 
 
 
363 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  37.63 
 
 
375 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3349  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.83 
 
 
375 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  37.37 
 
 
375 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3755  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  37.37 
 
 
375 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  37.1 
 
 
375 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3675  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  37.1 
 
 
375 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.83 
 
 
375 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3437  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.83 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3707  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.83 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.488381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
371 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245117  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.6 
 
 
374 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0351108 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  43.3 
 
 
371 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  43.3 
 
 
371 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.04 
 
 
372 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.28 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.61 
 
 
374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.73 
 
 
364 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.26 
 
 
373 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  42.48 
 
 
369 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  40.43 
 
 
369 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.04 
 
 
373 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.15 
 
 
367 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  42.67 
 
 
370 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.38 
 
 
355 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.11 
 
 
355 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  34.55 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.96 
 
 
368 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.85 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  42.42 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.41 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.41 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.41 
 
 
355 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.23 
 
 
367 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0341  N-ethylmaleimide reductase  41.81 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000113831  hitchhiker  0.00000000671042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0031  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.06 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.97 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  40.09 
 
 
365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.03 
 
 
366 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.6 
 
 
365 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.41 
 
 
355 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.6 
 
 
370 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  39.29 
 
 
362 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.21 
 
 
355 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  36.67 
 
 
364 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  40.34 
 
 
365 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0022  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.33 
 
 
374 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.788307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.43 
 
 
372 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  34.31 
 
 
385 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  40.18 
 
 
371 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.35 
 
 
364 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.64 
 
 
350 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0040  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.33 
 
 
374 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.91 
 
 
366 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  40.34 
 
 
365 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  40.34 
 
 
365 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.54 
 
 
371 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.7 
 
 
366 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.11 
 
 
378 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.24 
 
 
368 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.7 
 
 
368 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.27 
 
 
358 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  40.95 
 
 
366 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>