More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2959 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
374 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0436384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1928  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.5 
 
 
367 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1268  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.76 
 
 
371 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0160368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02130  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family protein  58.52 
 
 
365 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0972  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.94 
 
 
369 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.1 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.96 
 
 
385 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.77 
 
 
367 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0884  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.58 
 
 
367 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393971  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3097  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.47 
 
 
367 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432151  normal  0.23226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2070  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.82 
 
 
374 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4680  oxidoreductase  57.42 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4412  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.29 
 
 
367 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590199  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1173  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  55.59 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53400  oxidoreductase  56.87 
 
 
370 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1135  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.63 
 
 
366 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0661889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.13 
 
 
370 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.74 
 
 
367 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.0297494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3439  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.17 
 
 
366 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0406349  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3391  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.4 
 
 
363 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1461  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.62 
 
 
366 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.548376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2707  putative oxidoreductase  56.11 
 
 
372 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.49 
 
 
370 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.69 
 
 
368 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.334271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.38 
 
 
368 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.16 
 
 
378 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.54 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.37113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.87 
 
 
372 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582883  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.91 
 
 
363 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.91 
 
 
363 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.91 
 
 
363 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6910  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.37 
 
 
358 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.8 
 
 
380 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.27 
 
 
384 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.105187  hitchhiker  0.000875801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  35.87 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.8 
 
 
375 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3349  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.52 
 
 
375 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  35.75 
 
 
375 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  36.67 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3437  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.39 
 
 
375 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.39 
 
 
375 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3707  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.39 
 
 
375 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.488381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3755  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  35.75 
 
 
375 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  37.1 
 
 
375 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3675  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.02 
 
 
375 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.77 
 
 
366 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1253  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.5 
 
 
366 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  37.17 
 
 
378 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  35.14 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  34.32 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.41 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3367  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.69 
 
 
369 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2937  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.58 
 
 
365 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  43.07 
 
 
369 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.22 
 
 
654 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.31 
 
 
373 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.73 
 
 
355 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
355 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.78 
 
 
368 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0240  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.98 
 
 
347 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
355 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
355 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
355 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.93 
 
 
363 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.76 
 
 
355 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3080  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family  33.99 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.5 
 
 
355 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
372 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.59 
 
 
355 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  39.34 
 
 
371 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.24 
 
 
363 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  39.34 
 
 
371 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  32.67 
 
 
685 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.75 
 
 
378 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.54 
 
 
685 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.53 
 
 
355 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.12 
 
 
358 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.72 
 
 
364 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.24 
 
 
362 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.82 
 
 
378 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.11 
 
 
330 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1397  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.07 
 
 
351 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.18 
 
 
350 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.39 
 
 
646 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0537  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  34.63 
 
 
684 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.45506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.28 
 
 
373 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.29 
 
 
652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.2 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
555 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.496877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.2 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.53 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  40.36 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  42.17 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.65 
 
 
367 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.62 
 
 
367 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  39.39 
 
 
375 aa  146  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0341  N-ethylmaleimide reductase  40.97 
 
 
366 aa  146  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000113831  hitchhiker  0.00000000671042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.62 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.53 
 
 
377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>