More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0563 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
357 aa  717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4896  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.58 
 
 
357 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6328  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.34 
 
 
363 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36990  NADH:flavin oxidoreductase  58.81 
 
 
357 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.610852 
 
 
-
 
NC_003296  RS00904  NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  55.17 
 
 
359 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.890942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0492  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.45 
 
 
357 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.26 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.361607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3384  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.82 
 
 
363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000502558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3869  putative oxidoreductase  55.17 
 
 
359 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4722  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.6 
 
 
356 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  56.73 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.6 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1149  oxidoreductase  56.47 
 
 
355 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.54 
 
 
365 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.81 
 
 
371 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.86 
 
 
358 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1002  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
357 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.91 
 
 
462 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.18 
 
 
363 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.09 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.43 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.18 
 
 
373 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.18 
 
 
373 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.17 
 
 
364 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.32 
 
 
363 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
365 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
372 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
364 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.45 
 
 
364 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.33 
 
 
367 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5847  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
425 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.02 
 
 
360 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.5 
 
 
362 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.48 
 
 
358 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.24 
 
 
363 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  45.66 
 
 
364 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1213  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.31 
 
 
373 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  45.35 
 
 
365 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.96 
 
 
368 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.61 
 
 
364 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.74 
 
 
360 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  46.76 
 
 
372 aa  292  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  46.05 
 
 
360 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.16 
 
 
366 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.18 
 
 
359 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.5134  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
358 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.35 
 
 
363 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.65 
 
 
371 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
369 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1689  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 
368 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
370 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5069  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.01 
 
 
368 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169096  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.94 
 
 
366 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2748  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.77 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117541  normal  0.110878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.63 
 
 
404 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.78 
 
 
366 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
373 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.92 
 
 
359 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.54 
 
 
359 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  43.73 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.63 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.04 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  45.63 
 
 
373 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.2 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1438  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
375 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  hitchhiker  0.0000159573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4877  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.67 
 
 
368 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0637583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.6 
 
 
371 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.41 
 
 
365 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0031  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.75 
 
 
371 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371979 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  45.03 
 
 
363 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1883  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.37 
 
 
359 aa  278  8e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  44.32 
 
 
372 aa  278  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 
358 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
378 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.09 
 
 
373 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.97 
 
 
375 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
358 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.29 
 
 
354 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0323163  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  41.76 
 
 
366 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0988  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.61 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000470926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.18 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0106  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.15 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  42.54 
 
 
365 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  43.05 
 
 
371 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.25 
 
 
368 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  43.05 
 
 
371 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3610  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.76 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.432895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  42.54 
 
 
369 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3360  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.7 
 
 
356 aa  272  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 
363 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  42.03 
 
 
365 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.98 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.38 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.7 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.13 
 
 
364 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
378 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>