More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5552 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  88.27 
 
 
358 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
358 aa  729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.66 
 
 
358 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.74 
 
 
358 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.46 
 
 
362 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.81 
 
 
358 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1883  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.79 
 
 
359 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0106  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.11 
 
 
362 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1438  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.78 
 
 
361 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3487  NADH:flavin oxidoreductase family protein  51.96 
 
 
362 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.21 
 
 
359 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.7 
 
 
363 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
355 aa  355  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0189212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.94 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0323163  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.79 
 
 
369 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.79 
 
 
369 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2682  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.12 
 
 
372 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  47.63 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.03 
 
 
358 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.96 
 
 
364 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  46.76 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  46.09 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.35 
 
 
363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.04 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.91 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  44.74 
 
 
370 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  45.96 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.65 
 
 
366 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.37 
 
 
360 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.106909  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.75 
 
 
364 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  46.96 
 
 
365 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45 
 
 
373 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48 
 
 
368 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
366 aa  299  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  45.13 
 
 
364 aa  298  7e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.19 
 
 
360 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  48 
 
 
378 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.34 
 
 
373 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.06 
 
 
360 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.78 
 
 
380 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.45 
 
 
360 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.63 
 
 
363 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.35 
 
 
373 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.43 
 
 
368 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.35 
 
 
373 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
370 aa  295  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.789966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  44.59 
 
 
370 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.81 
 
 
356 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.63 
 
 
372 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2447  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
351 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.94 
 
 
366 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.72 
 
 
367 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
378 aa  292  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.25 
 
 
358 aa  291  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.49 
 
 
368 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4436  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.49 
 
 
369 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.89 
 
 
378 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0988  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.28 
 
 
359 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000470926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.7 
 
 
354 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.89 
 
 
378 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  47.06 
 
 
372 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.79 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.77 
 
 
366 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1213  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.76 
 
 
373 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
372 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
366 aa  289  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2028  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.25 
 
 
373 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
364 aa  288  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.88 
 
 
462 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.09 
 
 
367 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6908  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 
369 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4899  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 
369 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3264  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 
369 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.05 
 
 
371 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  44.59 
 
 
371 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2424  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.84 
 
 
371 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397481  normal  0.0764227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  42.5 
 
 
374 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.15 
 
 
367 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0341  N-ethylmaleimide reductase  43.49 
 
 
366 aa  285  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000113831  hitchhiker  0.00000000671042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.63 
 
 
367 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  42.22 
 
 
367 aa  285  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.38 
 
 
379 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.45 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.12 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.01 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36990  NADH:flavin oxidoreductase  46.24 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.610852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.85 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.77 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
349 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  45.35 
 
 
367 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  42.22 
 
 
363 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.75 
 
 
371 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
349 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  44.66 
 
 
350 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.04 
 
 
363 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>