51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0599 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  83.24 
 
 
173 aa  307  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  83.24 
 
 
173 aa  307  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  81.5 
 
 
173 aa  300  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  71.68 
 
 
173 aa  268  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  54.17 
 
 
171 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  47.67 
 
 
172 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  50.61 
 
 
170 aa  174  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  49.08 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 
170 aa  170  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  45.35 
 
 
176 aa  169  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  44.83 
 
 
176 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  47.56 
 
 
248 aa  167  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  46.95 
 
 
173 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  42.77 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  48.78 
 
 
166 aa  164  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  42.53 
 
 
176 aa  164  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  41.38 
 
 
176 aa  159  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  41.38 
 
 
176 aa  157  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  46.71 
 
 
175 aa  153  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  46.11 
 
 
178 aa  151  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 
168 aa  144  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  42.26 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  41.04 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  40.48 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  41.67 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  42.01 
 
 
221 aa  130  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  41.42 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  42.01 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.14 
 
 
226 aa  124  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  38.82 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  37.34 
 
 
169 aa  114  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  38.55 
 
 
217 aa  114  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  29.51 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  29.17 
 
 
137 aa  45.1  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  28.68 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  30.53 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  28.69 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  29.37 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  27.54 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  28.89 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  28.15 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  28.57 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  27.5 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  27.64 
 
 
145 aa  42  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  29.57 
 
 
139 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  26.47 
 
 
144 aa  42  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  28.33 
 
 
137 aa  41.6  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  25.83 
 
 
137 aa  41.6  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  27.41 
 
 
139 aa  41.2  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  26.36 
 
 
139 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>