34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30754 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  66.99 
 
 
221 aa  298  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  64.42 
 
 
220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  63.59 
 
 
216 aa  275  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  60.19 
 
 
217 aa  262  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  44.91 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  44 
 
 
173 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  42.17 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  43.11 
 
 
178 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  42.77 
 
 
172 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  43.71 
 
 
182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  42.17 
 
 
168 aa  125  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  41.14 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  43.11 
 
 
182 aa  124  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  41.76 
 
 
171 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  40.62 
 
 
248 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  41.42 
 
 
173 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  40.83 
 
 
173 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  40.83 
 
 
173 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  40.24 
 
 
170 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  38.55 
 
 
173 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  41.67 
 
 
175 aa  118  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  39.16 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  38.92 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  36.75 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  38.51 
 
 
175 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  36.14 
 
 
170 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  34.91 
 
 
176 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  34.32 
 
 
176 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  33.53 
 
 
176 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  33.72 
 
 
176 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  34.59 
 
 
176 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  34.18 
 
 
169 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  32.23 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>