37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1074 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 
173 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  76.19 
 
 
170 aa  277  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  74.55 
 
 
166 aa  274  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  74.12 
 
 
248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  73.94 
 
 
170 aa  269  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  61.21 
 
 
172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  61.59 
 
 
170 aa  222  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  60.84 
 
 
173 aa  217  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  58.93 
 
 
171 aa  210  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  50.89 
 
 
176 aa  186  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  50.3 
 
 
176 aa  185  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  50.89 
 
 
176 aa  184  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  49.11 
 
 
176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  50.89 
 
 
176 aa  180  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  50.61 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  46.99 
 
 
173 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  46.39 
 
 
173 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  46.39 
 
 
173 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  46.95 
 
 
186 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  41.57 
 
 
168 aa  140  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  38.86 
 
 
175 aa  135  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  42.01 
 
 
178 aa  132  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  43.37 
 
 
182 aa  130  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  42.01 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  39.77 
 
 
178 aa  129  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  40.25 
 
 
217 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  40.59 
 
 
175 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.55 
 
 
226 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  36.69 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  37.87 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  39.22 
 
 
169 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  33.33 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf435  50S ribosomal protein L16  34.17 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  31.65 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  31.65 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  31.65 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>