33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0848 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  76.19 
 
 		 173 aa  277  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  74.69 
 
 		 248 aa  271  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  75.15 
 
 		 166 aa  265  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  70.3 
 
 		 170 aa  261  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  62.58 
 
 		 170 aa  225  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  60.12 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  61.21 
 
 		 171 aa  211  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  58.54 
 
 		 173 aa  201  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  52.07 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  53.25 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  52.66 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  52.66 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  52.35 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  52.15 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  49.08 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  47.24 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  47.24 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  47.85 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  46.71 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  46.75 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  45.56 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  46.15 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  46.99 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  43.03 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  43.9 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  41.32 
 
 		 217 aa  129  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  42.17 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  40.36 
 
 		 220 aa  121  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.24 
 
 		 226 aa  121  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  40.61 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  39.29 
 
 		 216 aa  117  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  42.17 
 
 		 175 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>