91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1995 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  90 
 
 		 182 aa  337  4e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  90.8 
 
 		 182 aa  331  4e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  87.93 
 
 		 182 aa  320  5e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  62.65 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  59.76 
 
 		 168 aa  210  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  49.44 
 
 		 175 aa  167  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  48.84 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  50.88 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  45.03 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  46.15 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  47.88 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  45.83 
 
 		 248 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  45.83 
 
 		 221 aa  141  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  42.26 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  44.91 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  43.79 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  44.38 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 220 aa  137  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  43.27 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  41.04 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  42.26 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  41.04 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  42.26 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  42.01 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  42.01 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.11 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  41.14 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  40.83 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  40.49 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  31.82 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  32.23 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  33.06 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  31.34 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  31.4 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  49.12 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  31.4 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  33.62 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  32.23 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  32.23 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  32.2 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  31.06 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  51.06 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  31.67 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  53.19 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  42.86 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  30.33 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  44.23 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  50 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  55.32 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  31.9 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  31.67 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  29.66 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  31.15 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  48 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  46.15 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  28.69 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  30.56 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  30.33 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  44.68 
 
 		 137 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  48.94 
 
 		 137 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  50 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  51.06 
 
 		 142 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  26.28 
 
 		 138 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  27.54 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  48.94 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  50 
 
 		 146 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  51.06 
 
 		 142 aa  42  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  28.24 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  46.15 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  30.95 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  50 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  47.92 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  47.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  43.4 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  46.81 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  50 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  30.16 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  32.23 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  27.43 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  27.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  29.77 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000162016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  46.81 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  46.81 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  31.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  33.04 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  27.87 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  28.68 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>