36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0088 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 170 aa  356  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  73.94 
 
 		 173 aa  269  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  70.3 
 
 		 170 aa  261  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  70.12 
 
 		 248 aa  259  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  66.06 
 
 		 166 aa  244  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  64.63 
 
 		 170 aa  228  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  59.17 
 
 		 172 aa  224  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  59.64 
 
 		 173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  58.43 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  50.58 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  50.58 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  49.42 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  49.42 
 
 		 176 aa  183  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  50 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  51.22 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 		 186 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 		 173 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 		 173 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  47.93 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  45.03 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  45.88 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  45.61 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  45.03 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  40.48 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  41.57 
 
 		 178 aa  127  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  40.12 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  37.65 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 220 aa  118  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  38.41 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  35.29 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  37.13 
 
 		 221 aa  110  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.14 
 
 		 226 aa  107  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  38.51 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf435  50S ribosomal protein L16  30.3 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  26.97 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  27.27 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>