51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0181 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 170 aa  347  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  64.63 
 
 		 170 aa  228  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  65.24 
 
 		 172 aa  227  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  62.58 
 
 		 170 aa  225  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  61.59 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  62.8 
 
 		 166 aa  220  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  60.37 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  63.03 
 
 		 173 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  60.48 
 
 		 171 aa  207  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  54.49 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  55.09 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  54.49 
 
 		 176 aa  190  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  54.49 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  53.89 
 
 		 176 aa  183  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  53.05 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  53.05 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  53.05 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  51.52 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  50.61 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  48.45 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  47.27 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  47.88 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  47.88 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  49.09 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  46.01 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  43.71 
 
 		 221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  46.91 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.17 
 
 		 226 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  41.07 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  43.59 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  39.76 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  44 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  32.17 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  29.06 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  32.41 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0484  ribosomal protein L16  31.54 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  32.14 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  31.93 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  26.11 
 
 		 145 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  29.46 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  28.57 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  28.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  30.36 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  27.68 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0233  50S ribosomal protein L16  28.17 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  26.96 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  27.68 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  33.93 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  30.34 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  28.57 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>