35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0546 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 168 aa  344  4e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  60.36 
 
 		 182 aa  210  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  59.76 
 
 		 178 aa  210  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  59.76 
 
 		 182 aa  210  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  57.99 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  56.02 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  56.1 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  53.61 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  46.95 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  47.02 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  47.56 
 
 		 248 aa  150  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  46.71 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  48.45 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 186 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  41.57 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  40.48 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  42.42 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  38.6 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  39.18 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  44.97 
 
 		 221 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  40.35 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  39.88 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  38.6 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.17 
 
 		 226 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  42.01 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  38.6 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  39.29 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  40.96 
 
 		 217 aa  123  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  37.33 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  29.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000162016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  28.32 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>