More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2767 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000162016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  74.81 
 
 		 137 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2058  ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 137 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000772955  normal  0.0851183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0465  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0344  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1847  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00197207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  54.74 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001735  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  62.22 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000877255  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000412231  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4269  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000832167  unclonable  0.00000000000355687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 136 aa  160  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  60.61 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000800282  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000239067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3331  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000490254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 		 179 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  53.28 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0220  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 136 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000896692  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>