More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2058 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2058  ribosomal protein L16  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000772955  normal  0.0851183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000162016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 137 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 137 aa  192  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  60.9 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 145 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.15 
 
 		 141 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 139 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 144 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  57.35 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  55.15 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 144 aa  159  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 138 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  54.74 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0496  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  58.09 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  55.15 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3998  ribosomal protein L16  55.15 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.869429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3331  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000490254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1770  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000306557  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000877255  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>