More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0369 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  93.67 
 
 		 158 aa  303  7e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  89.87 
 
 		 158 aa  290  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  83.54 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  83.54 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  86.36 
 
 		 179 aa  266  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  87.77 
 
 		 160 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  81.65 
 
 		 160 aa  261  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  86.33 
 
 		 160 aa  260  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  86.33 
 
 		 160 aa  260  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  76.92 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  79.02 
 
 		 141 aa  228  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  78.47 
 
 		 142 aa  226  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  76.26 
 
 		 137 aa  221  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  74.82 
 
 		 139 aa  216  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  71.13 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  75.54 
 
 		 139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  75.54 
 
 		 139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  68.84 
 
 		 144 aa  207  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  65.49 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  65.28 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  65.28 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  68.57 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  65.49 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  64.79 
 
 		 140 aa  193  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  67.14 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  68.42 
 
 		 140 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 139 aa  190  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 139 aa  190  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  64.54 
 
 		 140 aa  189  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  64.34 
 
 		 141 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  67.14 
 
 		 139 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  64.03 
 
 		 145 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 137 aa  186  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  61.15 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 144 aa  184  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  60.96 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  56.58 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 138 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 138 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 138 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 		 143 aa  180  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  60 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  60 
 
 		 141 aa  177  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>