More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0405 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 145 aa  209  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  74.81 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  74.81 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 139 aa  204  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 144 aa  203  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 139 aa  203  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  72.59 
 
 		 140 aa  203  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 		 139 aa  202  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  72.59 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 151 aa  201  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  71.85 
 
 		 139 aa  201  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  72.59 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 139 aa  201  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 145 aa  201  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  70.37 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  67.61 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  68.84 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 139 aa  196  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 138 aa  196  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 144 aa  197  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 137 aa  196  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  71.85 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  67.38 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  64.79 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  64.79 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  69.63 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  66.19 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 138 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 142 aa  193  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  68.15 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 144 aa  189  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 138 aa  189  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  66.67 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 139 aa  186  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  62.68 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  61.9 
 
 		 158 aa  185  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  65.03 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.42 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.42 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  63.97 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  65.25 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  65.25 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>