More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3916 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  92.86 
 
 		 141 aa  269  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  83.57 
 
 		 139 aa  238  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  82.14 
 
 		 139 aa  233  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  78.01 
 
 		 139 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  76.43 
 
 		 139 aa  225  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 138 aa  225  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  80.43 
 
 		 139 aa  224  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  79.86 
 
 		 138 aa  224  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  78.01 
 
 		 139 aa  223  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  79.86 
 
 		 139 aa  223  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  75.71 
 
 		 139 aa  222  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  76.98 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  77.86 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  77.14 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  75.54 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 139 aa  216  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  76.43 
 
 		 138 aa  216  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 138 aa  215  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  72.34 
 
 		 139 aa  214  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  75 
 
 		 138 aa  213  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 		 138 aa  213  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 138 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 138 aa  210  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  74.29 
 
 		 138 aa  209  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  72.86 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  68.79 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  67.86 
 
 		 139 aa  200  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  66.43 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  67.14 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  65.25 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  65.73 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 145 aa  176  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  59.86 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  64.08 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  58.87 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 144 aa  167  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  60.14 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  54.29 
 
 		 140 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 141 aa  158  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  55.47 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  55.17 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  56.12 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  54.35 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 139 aa  156  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  53.68 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.25 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  55.32 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  55.32 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>