More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0938 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  84.89 
 
 		 139 aa  252  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  84.44 
 
 		 138 aa  242  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  84.06 
 
 		 138 aa  240  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  81.29 
 
 		 139 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  82.61 
 
 		 138 aa  237  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  80.88 
 
 		 139 aa  237  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  81.16 
 
 		 139 aa  236  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  79.41 
 
 		 139 aa  236  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  80.29 
 
 		 139 aa  234  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  81.88 
 
 		 138 aa  234  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  80.29 
 
 		 139 aa  233  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  81.75 
 
 		 138 aa  233  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  78.42 
 
 		 139 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  81.48 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  80.74 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  80 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  80 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  77.54 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  80 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  80 
 
 		 138 aa  230  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  82.22 
 
 		 138 aa  229  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  79.71 
 
 		 138 aa  229  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  75.54 
 
 		 139 aa  229  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  80.15 
 
 		 139 aa  229  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  81.48 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  78.99 
 
 		 139 aa  228  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  77.7 
 
 		 139 aa  227  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  75.54 
 
 		 139 aa  224  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  76.43 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  76.43 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  73.91 
 
 		 139 aa  220  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  76.09 
 
 		 138 aa  219  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  73.76 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 144 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  56.52 
 
 		 141 aa  173  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  56.52 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  58.82 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  56.52 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  58.52 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  55.8 
 
 		 141 aa  166  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  57.97 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  58.87 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3998  ribosomal protein L16  55.56 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.869429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>