More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1714 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
139 aa  283  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  92.81 
 
 
139 aa  269  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  72.46 
 
 
139 aa  222  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  72.79 
 
 
138 aa  219  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  72.66 
 
 
139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  70.8 
 
 
139 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  71.94 
 
 
139 aa  215  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  71.01 
 
 
138 aa  214  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  71.22 
 
 
139 aa  213  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  68.84 
 
 
138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  70.8 
 
 
139 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 
138 aa  210  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  70.37 
 
 
139 aa  209  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 
138 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  69.06 
 
 
139 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 
139 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  67.63 
 
 
139 aa  207  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 
139 aa  207  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  70.37 
 
 
139 aa  206  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  70.29 
 
 
138 aa  206  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  68.38 
 
 
139 aa  206  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
138 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  67.63 
 
 
139 aa  204  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  69.12 
 
 
137 aa  203  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
138 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  68.15 
 
 
138 aa  197  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  67.14 
 
 
141 aa  197  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  67.14 
 
 
141 aa  197  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 
138 aa  193  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  65.93 
 
 
140 aa  193  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  64.54 
 
 
141 aa  192  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 
144 aa  191  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  191  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
144 aa  190  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  65.19 
 
 
138 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  189  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  62.14 
 
 
145 aa  188  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
138 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 
145 aa  188  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
141 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
138 aa  186  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
138 aa  186  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
143 aa  186  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
138 aa  186  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
144 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 
144 aa  184  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 
144 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 
144 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 
144 aa  183  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
145 aa  184  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  59.29 
 
 
144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
139 aa  179  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
145 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  61.48 
 
 
140 aa  178  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  60.74 
 
 
145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  58.57 
 
 
144 aa  177  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  60 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
143 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
139 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
142 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
139 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
140 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  57.97 
 
 
138 aa  173  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
137 aa  173  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
151 aa  173  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  53.96 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  58.57 
 
 
145 aa  169  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
138 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
143 aa  169  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
137 aa  169  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  58.04 
 
 
160 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 
160 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  56.52 
 
 
141 aa  167  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
137 aa  168  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
139 aa  167  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
139 aa  167  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
144 aa  166  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
160 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
160 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  59.85 
 
 
137 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
137 aa  165  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 
137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>