More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2900 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  87.94 
 
 
141 aa  255  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  75.89 
 
 
141 aa  228  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  70.37 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
144 aa  198  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  69.63 
 
 
145 aa  196  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
145 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 
144 aa  193  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 
143 aa  193  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
142 aa  193  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
147 aa  191  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
145 aa  189  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
145 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  66.67 
 
 
140 aa  188  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  61.7 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
144 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  67.16 
 
 
144 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 
144 aa  185  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 
144 aa  185  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  64.79 
 
 
144 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  60.14 
 
 
139 aa  184  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  61.03 
 
 
137 aa  183  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  62.68 
 
 
142 aa  183  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  61.15 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 
139 aa  181  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
140 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 
142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 
143 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  180  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
142 aa  180  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
144 aa  180  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  58.27 
 
 
139 aa  180  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.57 
 
 
140 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  179  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
137 aa  179  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 
141 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
139 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
139 aa  178  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
140 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  178  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
139 aa  178  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0296  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  57.97 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
140 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 
139 aa  176  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  176  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 
160 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  58.99 
 
 
139 aa  176  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 
160 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
139 aa  176  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 
160 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  60 
 
 
139 aa  176  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
149 aa  176  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
149 aa  176  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  63.97 
 
 
144 aa  176  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  62.22 
 
 
137 aa  175  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
160 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
138 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  175  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  62.22 
 
 
141 aa  175  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  60 
 
 
139 aa  175  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
151 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
139 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  65.93 
 
 
137 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  174  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  56.52 
 
 
139 aa  173  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 
141 aa  173  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  60.14 
 
 
141 aa  173  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  60.29 
 
 
140 aa  173  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  58.99 
 
 
141 aa  173  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 
141 aa  173  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 
158 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 
139 aa  173  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  58.7 
 
 
139 aa  173  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>