More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3005 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
137 aa  276  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  82.48 
 
 
139 aa  230  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  82.48 
 
 
139 aa  230  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  80.88 
 
 
141 aa  230  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  80 
 
 
140 aa  229  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 
139 aa  228  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  80.15 
 
 
142 aa  228  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  78.26 
 
 
179 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  76.26 
 
 
161 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  76.26 
 
 
161 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  76.26 
 
 
158 aa  221  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  76.81 
 
 
142 aa  222  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  74.1 
 
 
160 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  79.1 
 
 
158 aa  220  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  77.61 
 
 
158 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 
160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 
144 aa  213  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 
144 aa  213  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 
145 aa  210  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 
144 aa  210  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 
142 aa  209  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 
145 aa  207  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 
144 aa  207  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 
144 aa  206  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 
139 aa  204  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 
139 aa  204  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 
141 aa  204  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  68.38 
 
 
145 aa  204  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
144 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 
139 aa  203  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  68.89 
 
 
151 aa  203  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 
139 aa  203  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
147 aa  202  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 
139 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 
139 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 
139 aa  201  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 
149 aa  200  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 
149 aa  199  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  71.64 
 
 
138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
144 aa  197  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 
144 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 
144 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  67.65 
 
 
145 aa  196  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 
151 aa  196  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 
144 aa  196  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 
143 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 
144 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 
144 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
143 aa  193  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  65.69 
 
 
140 aa  193  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
139 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
140 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  72.06 
 
 
137 aa  191  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  66.18 
 
 
140 aa  191  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
140 aa  190  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
141 aa  190  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  66.18 
 
 
144 aa  189  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
145 aa  189  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
141 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
141 aa  189  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
140 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
137 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  65.19 
 
 
138 aa  186  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
140 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
137 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
140 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
137 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  63.97 
 
 
143 aa  185  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  62.96 
 
 
137 aa  185  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  184  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
138 aa  184  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
137 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
137 aa  184  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
138 aa  183  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
137 aa  183  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  63.7 
 
 
139 aa  183  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
137 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  63.7 
 
 
139 aa  182  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
144 aa  182  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
144 aa  182  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  65.93 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0496  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>