More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09930 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  100 
 
 		 140 aa  283  8e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  90.71 
 
 		 140 aa  259  8.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  86.13 
 
 		 143 aa  246  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  79.85 
 
 		 141 aa  216  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  71.74 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 145 aa  203  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  71.01 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  71.01 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  71.85 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  70.29 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  68.84 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  71.11 
 
 		 145 aa  197  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  70 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 145 aa  192  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 139 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  186  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  186  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 138 aa  186  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  186  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  70.5 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 139 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 139 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  183  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  182  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  63.7 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  62.59 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  66.92 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  61.76 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  64.03 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  62.22 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 151 aa  176  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 138 aa  176  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  58.99 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>