More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0190 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  72.86 
 
 
140 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  72.86 
 
 
140 aa  213  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  69.78 
 
 
139 aa  209  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  72.26 
 
 
143 aa  207  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  72.54 
 
 
142 aa  204  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 
141 aa  203  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 
139 aa  203  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  68.12 
 
 
139 aa  201  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
139 aa  197  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.71 
 
 
145 aa  197  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
139 aa  197  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  67.86 
 
 
144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 
144 aa  192  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 
144 aa  192  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
140 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 
142 aa  191  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 
139 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 
139 aa  190  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 
139 aa  190  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 
138 aa  189  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
141 aa  189  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 
139 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 
142 aa  189  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 
139 aa  188  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 
137 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 
144 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 
144 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
137 aa  188  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  65.44 
 
 
145 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  65.44 
 
 
145 aa  187  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
144 aa  187  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
147 aa  186  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 
141 aa  186  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
142 aa  186  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
140 aa  186  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  69.7 
 
 
140 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
140 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  69.17 
 
 
138 aa  184  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
140 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
179 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
137 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
140 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
137 aa  182  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  66.91 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  58.87 
 
 
161 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  58.87 
 
 
161 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  68.42 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  65.41 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  68.42 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  65.41 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 
144 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  66.67 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  58.74 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  68.42 
 
 
136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  66.92 
 
 
137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  68.42 
 
 
136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
137 aa  180  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  67.67 
 
 
136 aa  180  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 
137 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
160 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  66.92 
 
 
140 aa  180  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  64.71 
 
 
143 aa  179  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  66.92 
 
 
136 aa  179  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  60.14 
 
 
158 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 
137 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 
137 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
141 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
144 aa  178  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 
137 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  67.42 
 
 
137 aa  178  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 
138 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 
137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 
137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>