More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2973 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  85.51 
 
 		 138 aa  240  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 138 aa  233  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  224  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  221  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  221  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  221  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  220  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 139 aa  220  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  220  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  219  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 137 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  76.81 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  75.56 
 
 		 146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 		 137 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 137 aa  206  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  206  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 		 137 aa  204  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 		 137 aa  204  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 137 aa  201  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  193  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 141 aa  191  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 139 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  69.17 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  183  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  183  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143497  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000060598  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.0000683618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1271  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00776716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000688504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0345  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.739822  decreased coverage  0.000284726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3788  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 138 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0821635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  60 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>