More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2681 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 138 aa  233  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 137 aa  231  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  82.22 
 
 		 137 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 137 aa  229  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  227  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  226  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  226  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 143 aa  226  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  226  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  223  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  223  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  78.26 
 
 		 144 aa  223  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  78.26 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  219  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  217  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 139 aa  217  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 146 aa  216  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  214  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  80.29 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  207  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  207  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  207  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  206  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  206  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 141 aa  191  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 142 aa  190  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.0000683618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000688504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000060598  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 139 aa  189  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  189  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2365  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000850628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  186  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  186  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3788  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0821635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  185  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>