More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1256 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  88.81 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  80.71 
 
 		 143 aa  229  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  78.26 
 
 		 138 aa  223  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  215  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 		 137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 		 137 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 		 137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 		 146 aa  209  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  71.64 
 
 		 137 aa  207  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 137 aa  207  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 137 aa  207  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 137 aa  206  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  205  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  205  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  72.66 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 137 aa  200  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0177  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 136 aa  180  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  180  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000412231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0155  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000013379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001735  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  63.43 
 
 		 136 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  177  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000060598  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.0000683618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000688504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000239067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000800282  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  64.34 
 
 		 137 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000850628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 139 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0220  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000896692  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 139 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1847  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00197207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0344  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  61.54 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3908  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000657151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0591  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146592  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0290  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000162666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  170  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>