More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2743 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 137 aa  227  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  224  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  225  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  225  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 138 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  79.85 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  79.85 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  80.6 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 138 aa  220  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  79.85 
 
 		 137 aa  220  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  221  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  79.85 
 
 		 137 aa  220  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  79.85 
 
 		 137 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  77.61 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 138 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  77.61 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  79.1 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  77.54 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  84.33 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 137 aa  210  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  74.82 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  206  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  72.66 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  204  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  203  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 137 aa  200  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  72.59 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 141 aa  181  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4906  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0575421  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  175  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0285  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931697  hitchhiker  0.0000000330456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0280  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  174  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0345  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.739822  decreased coverage  0.000284726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>