More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1622 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  76.81 
 
 		 140 aa  223  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 139 aa  209  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  69.06 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 		 139 aa  203  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  72.59 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  69.06 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  190  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 144 aa  187  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 137 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 144 aa  187  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  186  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  184  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  183  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 141 aa  179  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 144 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 144 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1411  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  177  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>