More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0390 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  87.14 
 
 		 139 aa  244  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  80.71 
 
 		 141 aa  233  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  74.82 
 
 		 140 aa  213  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  72.14 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.71 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  67.38 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 139 aa  189  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  68.31 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 139 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 137 aa  171  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 139 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 139 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  169  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000412231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001735  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  62.22 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  59.29 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 141 aa  167  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 161 aa  166  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 142 aa  167  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 144 aa  166  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  58.27 
 
 		 137 aa  167  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0290  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000162666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0591  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146592  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3908  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000657151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  60 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>