More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4350 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  82.98 
 
 		 143 aa  234  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  79.86 
 
 		 140 aa  228  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  78.17 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  72.54 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 139 aa  190  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  69.06 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 139 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  68.31 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 139 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  63.38 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  61.27 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.45 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 179 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 		 144 aa  176  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  61.11 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  57.45 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  57.45 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 161 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  58.45 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  60.14 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3788  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0821635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  58.74 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  58.7 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4906  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0575421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  57.97 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>