More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1931 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 140 aa  223  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  69.5 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 139 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  67.13 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  60.14 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 139 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  176  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  57.25 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  57.25 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  57.25 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  55.8 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  54.17 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  56.52 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  56.64 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  55.4 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  56.55 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  58.16 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  54.93 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  56.64 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  56.52 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  56.52 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>