More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3710 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  86.96 
 
 		 139 aa  253  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  86.96 
 
 		 139 aa  253  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  86.76 
 
 		 141 aa  245  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  86.03 
 
 		 142 aa  243  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  83.7 
 
 		 140 aa  240  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  81.16 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  77.7 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 		 145 aa  221  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  76.81 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  73.76 
 
 		 161 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  73.76 
 
 		 161 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  75.36 
 
 		 160 aa  220  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  73.19 
 
 		 160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 		 160 aa  216  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  74.82 
 
 		 158 aa  216  7e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 		 160 aa  216  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  74.82 
 
 		 158 aa  216  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 144 aa  216  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 142 aa  214  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  75 
 
 		 144 aa  214  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  75 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  73.53 
 
 		 145 aa  214  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  73.53 
 
 		 145 aa  213  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 144 aa  212  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  71.85 
 
 		 151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 144 aa  206  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 144 aa  206  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  72.79 
 
 		 139 aa  206  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 144 aa  203  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 139 aa  203  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 144 aa  200  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 145 aa  196  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 140 aa  196  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 140 aa  196  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 149 aa  196  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 137 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 144 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  67.88 
 
 		 143 aa  193  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4906  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0575421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0280  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0285  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931697  hitchhiker  0.0000000330456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 138 aa  190  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 138 aa  189  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 137 aa  189  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0345  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.739822  decreased coverage  0.000284726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0988  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.702357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0210  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  68.61 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>