More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2130 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
137 aa  274  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
137 aa  274  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
137 aa  274  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  90.51 
 
 
137 aa  258  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  89.05 
 
 
137 aa  253  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  89.05 
 
 
137 aa  253  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  85.4 
 
 
137 aa  238  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  81.75 
 
 
137 aa  231  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  81.75 
 
 
137 aa  231  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  80.29 
 
 
137 aa  229  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 
137 aa  229  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 
137 aa  229  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 
137 aa  228  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 
138 aa  226  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  80 
 
 
146 aa  224  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 
137 aa  224  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 
137 aa  223  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  78.36 
 
 
137 aa  223  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  80.6 
 
 
137 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  80.6 
 
 
137 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 
137 aa  219  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 
137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  78.36 
 
 
137 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 
137 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 
137 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  75.37 
 
 
137 aa  213  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 
138 aa  213  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  73.72 
 
 
137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 
139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 
137 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 
138 aa  209  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 
137 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 
137 aa  209  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 
137 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 
137 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 
143 aa  204  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 
137 aa  203  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 
137 aa  203  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 
137 aa  201  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 
144 aa  201  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 
143 aa  196  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 
137 aa  196  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.18 
 
 
151 aa  183  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
137 aa  183  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  65.89 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  67.91 
 
 
143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 
137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
142 aa  179  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  65.67 
 
 
140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
138 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  58.52 
 
 
137 aa  177  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
138 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  176  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.69 
 
 
144 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
141 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  63.43 
 
 
139 aa  175  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
141 aa  174  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
144 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  174  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
142 aa  172  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1271  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00776716  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3788  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0821635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4906  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0575421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0345  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.739822  decreased coverage  0.000284726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2365  50S ribosomal protein L16  62.02 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0263  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290955  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000239067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0280  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0210  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0285  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931697  hitchhiker  0.0000000330456 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000800282  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000877255  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>