More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1939 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  276  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  85.51 
 
 		 138 aa  240  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  227  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  226  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  226  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  226  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  78.52 
 
 		 137 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  224  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 		 139 aa  223  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 146 aa  221  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  219  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  217  6e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  217  6e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  76.12 
 
 		 137 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  73.91 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  76.87 
 
 		 137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 143 aa  208  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  205  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 144 aa  203  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  203  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 137 aa  203  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 137 aa  200  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 151 aa  184  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3331  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000490254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 143 aa  180  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000688504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000060598  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.0000683618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 136 aa  176  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>