More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4500 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  91.91 
 
 		 138 aa  259  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  88.97 
 
 		 138 aa  256  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  87.68 
 
 		 139 aa  253  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  86.76 
 
 		 139 aa  251  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  84.56 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  86.76 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  86.03 
 
 		 138 aa  246  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  85.93 
 
 		 139 aa  245  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  84.89 
 
 		 139 aa  243  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  84.44 
 
 		 139 aa  243  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  84.56 
 
 		 138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  83.82 
 
 		 139 aa  241  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  81.75 
 
 		 137 aa  241  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  83.09 
 
 		 139 aa  241  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  83.09 
 
 		 138 aa  239  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  83.7 
 
 		 138 aa  239  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  83.09 
 
 		 138 aa  238  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  80.88 
 
 		 139 aa  234  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  79.41 
 
 		 139 aa  232  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  80.15 
 
 		 139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  80 
 
 		 138 aa  229  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  81.48 
 
 		 139 aa  228  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 139 aa  228  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  77.78 
 
 		 139 aa  228  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  77.21 
 
 		 138 aa  225  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  79.43 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 138 aa  223  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 138 aa  221  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 138 aa  220  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 138 aa  220  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 138 aa  220  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  77.04 
 
 		 138 aa  220  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  72.79 
 
 		 139 aa  219  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  75.56 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 141 aa  217  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  76.64 
 
 		 141 aa  217  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  70.21 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 140 aa  206  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  71.11 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  70.5 
 
 		 144 aa  203  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  66.67 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  66.42 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 141 aa  193  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  69.63 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  68.84 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 137 aa  186  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 141 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 137 aa  176  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 139 aa  176  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>