More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5131 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  100 
 
 		 137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  86.76 
 
 		 138 aa  248  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  85.29 
 
 		 138 aa  243  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  81.75 
 
 		 138 aa  241  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  83.09 
 
 		 138 aa  240  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  84.67 
 
 		 139 aa  239  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  82.22 
 
 		 139 aa  239  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  81.62 
 
 		 139 aa  239  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  84.44 
 
 		 139 aa  239  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  80.88 
 
 		 139 aa  238  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  83.7 
 
 		 139 aa  236  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  80.15 
 
 		 139 aa  236  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  81.48 
 
 		 138 aa  234  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  79.41 
 
 		 138 aa  233  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  82.35 
 
 		 139 aa  233  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  82.35 
 
 		 139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  81.48 
 
 		 139 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  79.41 
 
 		 139 aa  229  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  78.68 
 
 		 138 aa  225  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  79.41 
 
 		 138 aa  225  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  78.68 
 
 		 139 aa  224  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  78.68 
 
 		 138 aa  224  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 138 aa  223  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  82.48 
 
 		 141 aa  223  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  75.74 
 
 		 139 aa  223  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  78.52 
 
 		 138 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  78.52 
 
 		 138 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  78.52 
 
 		 138 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  78.52 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  79.26 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  77.21 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  77.78 
 
 		 138 aa  220  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  73.33 
 
 		 139 aa  214  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  74.07 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  74.81 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  72.59 
 
 		 145 aa  207  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  71.11 
 
 		 144 aa  206  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  71.85 
 
 		 145 aa  206  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 144 aa  200  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 145 aa  200  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  70.37 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  196  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  196  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 151 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 145 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  64.44 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  65.69 
 
 		 140 aa  192  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  71.64 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  184  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 141 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 137 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>