More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0667 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
137 aa  271  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  90.51 
 
 
137 aa  257  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  89.78 
 
 
137 aa  256  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  81.75 
 
 
137 aa  229  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  76.3 
 
 
135 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000162016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2058  ribosomal protein L16  67.65 
 
 
137 aa  194  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000772955  normal  0.0851183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 
138 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
137 aa  179  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
140 aa  175  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
144 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
141 aa  174  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
141 aa  174  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
147 aa  174  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 
145 aa  174  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
137 aa  174  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
139 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 
140 aa  173  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 
140 aa  173  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
137 aa  173  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  61.03 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000877255  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
140 aa  170  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
137 aa  170  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
137 aa  170  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  170  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  59.12 
 
 
151 aa  170  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  61.31 
 
 
145 aa  169  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
137 aa  169  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
144 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
139 aa  169  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
140 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 
141 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  62.96 
 
 
137 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  168  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  168  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  59.56 
 
 
137 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
144 aa  168  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  168  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  58.96 
 
 
140 aa  167  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0433  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
137 aa  168  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574852  hitchhiker  0.0000247561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  167  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  167  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
137 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  167  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  167  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
158 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3331  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
138 aa  167  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000490254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
139 aa  167  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  167  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  56.72 
 
 
137 aa  167  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
144 aa  166  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
144 aa  166  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
144 aa  166  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
137 aa  166  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
145 aa  166  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 
141 aa  166  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
139 aa  166  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  166  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
136 aa  165  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000800282  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
144 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>