40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0902 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  90.61 
 
 
182 aa  339  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  88.46 
 
 
182 aa  338  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  87.93 
 
 
178 aa  320  5e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  63.37 
 
 
175 aa  218  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  57.99 
 
 
168 aa  208  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  51.19 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  50 
 
 
178 aa  162  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  48.24 
 
 
175 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  45.61 
 
 
170 aa  147  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  46.75 
 
 
170 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  47.88 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  46.25 
 
 
217 aa  141  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  44.05 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  45.24 
 
 
221 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  44.44 
 
 
220 aa  136  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
176 aa  134  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  43.2 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  43.2 
 
 
166 aa  134  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  42.01 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 
173 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 
173 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  41.67 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  42.69 
 
 
216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  41.67 
 
 
173 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  41.42 
 
 
176 aa  131  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  42.01 
 
 
173 aa  130  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  42.01 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  40.83 
 
 
176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.71 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  39.88 
 
 
169 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  30.43 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  29.57 
 
 
141 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  29.57 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  29.57 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  44.44 
 
 
141 aa  40.8  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  31.3 
 
 
138 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  45.28 
 
 
139 aa  40.8  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>