39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0534 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 173 aa  356  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 173 aa  356  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  95.95 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  83.24 
 
 		 186 aa  307  5e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  69.36 
 
 		 173 aa  260  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  50.58 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  53.05 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  46.82 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  52.98 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  49.39 
 
 		 248 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 		 170 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  47.24 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  46.39 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  40.8 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  43.1 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  41.38 
 
 		 176 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  43.02 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  46.34 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  47.59 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  39.08 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  47.59 
 
 		 178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  41.04 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  39.64 
 
 		 221 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.83 
 
 		 226 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  39.05 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  40.13 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  37.06 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  36.75 
 
 		 217 aa  110  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  31.54 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  27.61 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  31.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  29.55 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  29.41 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  30.77 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>