54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0917 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  91.16 
 
 
182 aa  342  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  90.61 
 
 
182 aa  339  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  90.8 
 
 
178 aa  331  4e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  63.95 
 
 
175 aa  220  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  60.36 
 
 
168 aa  210  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  49.41 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  48.24 
 
 
175 aa  159  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  50.3 
 
 
171 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  45.88 
 
 
170 aa  148  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  49.09 
 
 
170 aa  143  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  46.99 
 
 
170 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  44.31 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  45.83 
 
 
221 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  43.27 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  43.79 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  44.44 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  41.04 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  43.86 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  43.2 
 
 
176 aa  132  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  42.51 
 
 
166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  43.2 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  43.37 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  40.46 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  41.67 
 
 
173 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  42.01 
 
 
176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  41.42 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.11 
 
 
226 aa  124  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  40.83 
 
 
176 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  40.49 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  28.03 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  29.1 
 
 
137 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  32.11 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  32.11 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  32.11 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  45.16 
 
 
144 aa  44.7  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  30.43 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  33.03 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  53.19 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  29.66 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  48.08 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  42.59 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  51.06 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  27.08 
 
 
145 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  28.03 
 
 
137 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  33.03 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  42.11 
 
 
139 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  30.36 
 
 
139 aa  41.2  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  29.27 
 
 
137 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  50 
 
 
140 aa  40.8  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  31.19 
 
 
137 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>