35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1371 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 173 aa  362  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  72.83 
 
 		 172 aa  268  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  63.03 
 
 		 170 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  60.84 
 
 		 173 aa  217  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  59.64 
 
 		 170 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  56.97 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  57.23 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  58.54 
 
 		 170 aa  201  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  58.48 
 
 		 171 aa  196  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  51.72 
 
 		 176 aa  191  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  51.16 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  50 
 
 		 176 aa  187  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  48.84 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  50 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  49.13 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  46.82 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  47.4 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  46.82 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  42.77 
 
 		 186 aa  165  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  43.2 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  43.79 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  42.01 
 
 		 182 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  44.17 
 
 		 169 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  39.29 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  40.48 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  37.28 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  41.57 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  37.87 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  38.32 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  40.58 
 
 		 217 aa  110  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.75 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  27.97 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  29.55 
 
 		 137 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>