70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0013 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  71.68 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  71.1 
 
 		 173 aa  264  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  69.36 
 
 		 173 aa  260  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  69.36 
 
 		 173 aa  260  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  54.17 
 
 		 171 aa  184  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  50 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  49.13 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  51.52 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  52.15 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  50.61 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  51.22 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  48.78 
 
 		 248 aa  167  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  44.19 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  45.35 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  48.17 
 
 		 166 aa  164  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  48.8 
 
 		 178 aa  163  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  43.1 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  43.6 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  43.68 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  46.99 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  46.95 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  42.26 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  42.26 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  43.45 
 
 		 182 aa  139  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44 
 
 		 226 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  43.2 
 
 		 221 aa  130  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 220 aa  127  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  41.42 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  40 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  42 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  41.32 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  31.15 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  30.33 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  29.69 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  30 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  30.66 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  30.08 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  28.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  29.2 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  28.57 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  29.2 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  28.91 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  28.91 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  27.93 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  29.57 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  29.17 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  27.87 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  27.87 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  28.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  31.13 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  31.13 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  29.46 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  27.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0233  50S ribosomal protein L16  31.47 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  27.93 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3916  50S ribosomal protein L16  28.03 
 
 		 141 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4308  50S ribosomal protein L16  28.03 
 
 		 141 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158733  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  29.51 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  26.89 
 
 		 145 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  30.36 
 
 		 139 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1192  50S ribosomal protein L16  30.19 
 
 		 141 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  27.64 
 
 		 137 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  32.14 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  28.57 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  28.26 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  30 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  31.13 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  29.2 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>