More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0554 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1433  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  86.24 
 
 		 380 aa  689    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.498854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0554  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  100 
 
 		 381 aa  779    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0486  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  87.04 
 
 		 380 aa  692    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0351  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  85.45 
 
 		 380 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0681  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  69.03 
 
 		 385 aa  566  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1638  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0102  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1440  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0796  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1614  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.193363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1209  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0071  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0929376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2180  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1050  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0931794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1214  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000547302  normal  0.0195225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1163  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 462 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.937878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2045  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0348  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0463622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.99 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.14 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  26.7 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  23.08 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.29 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.8 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.89 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.27 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.21 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.7 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  36.59 
 
 		 879 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  26 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  30.72 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  28.72 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.64 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  26.18 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.78 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.32 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  24.68 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  31.08 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  28.77 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.45 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.38 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.44 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.93 
 
 		 657 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  29.08 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.15 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.84 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.21 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  27.45 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.91 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  35.71 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  27.22 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  24.47 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.36 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.75 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.22 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  39.39 
 
 		 896 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  32.41 
 
 		 441 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  33.73 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  22.65 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  32.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  25.62 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.44 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  26.8 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  33.7 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  35.71 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  25.22 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.39 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  22.61 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.3 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  27.92 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.76 
 
 		 423 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  27.92 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  36.67 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  34.29 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  27.92 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.29 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  32.88 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  30 
 
 		 880 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.71 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.78 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  32 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>