More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2180 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2180  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  100 
 
 		 456 aa  947    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0796  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 459 aa  653    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2045  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  71.68 
 
 		 454 aa  697    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1209  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  69.91 
 
 		 459 aa  684    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1163  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 462 aa  702    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.937878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1050  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  62.4 
 
 		 392 aa  531  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0931794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1614  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.193363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0071  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0929376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0348  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 392 aa  495  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0463622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1214  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000547302  normal  0.0195225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1638  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0681  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 385 aa  277  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1440  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 387 aa  276  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0554  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1433  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.498854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0486  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0351  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0102  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  28.04 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  28.04 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.46 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  35.44 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  23.81 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.1 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  26.54 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.12 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  29.05 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  24.1 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  29.3 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.51 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.48 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  26.74 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.12 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.15 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.58 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.39 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.39 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  34.15 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.39 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.26 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.39 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.52 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  24.58 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.39 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.9 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  28.24 
 
 		 604 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.12 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.9 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.51 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  27.75 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  28.24 
 
 		 604 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.12 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.73 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  26.9 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  30.28 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.55 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  25.95 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  28.79 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.86 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  28.47 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.49 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  25.62 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  22.9 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.49 
 
 		 641 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.3 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.54 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.61 
 
 		 674 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  25.15 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.61 
 
 		 672 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.3 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  28 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  24.75 
 
 		 896 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  24.24 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.15 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  22.58 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  25.9 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  27.21 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.6 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.71 
 
 		 572 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.61 
 
 		 673 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.79 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.3 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.03 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.3 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  30 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  20.15 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  25.3 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  25.37 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.1 
 
 		 608 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  26.09 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.91 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  29.07 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  26.35 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>