More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3621 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3621  fumarate hydratase  100 
 
 		 470 aa  949    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572718  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4596  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 463 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1437  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 468 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  47.16 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  48.57 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  48.57 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  47.48 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  48.79 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  48.35 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  47.26 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  48.13 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  47.06 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  48.25 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  46.83 
 
 		 482 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  46.39 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  48.37 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  47.25 
 
 		 463 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  47.83 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  48.58 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  44.64 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  46.05 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  47.28 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  49.45 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  48.35 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  48.36 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  49.45 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  48.35 
 
 		 472 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  46.05 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  46.15 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  46.1 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  48.13 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  46.41 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  44.62 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  45.97 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  48.13 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  45.93 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  46.15 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  47.06 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  46.15 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  45.23 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  49.23 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  45.27 
 
 		 462 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  44.84 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5517  fumarate hydratase  49.22 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  47.61 
 
 		 487 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  44.84 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  47.33 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  46.1 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  45.34 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  44.08 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  48.47 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  46.62 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  46.84 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  44.08 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  46.51 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  46.93 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  48.04 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  46.62 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  43.01 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  46.93 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  46.74 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  49.13 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  43.97 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  42.36 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  47.05 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  44.98 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  46.87 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  46.84 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  46.74 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  45.41 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  42.36 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  47.61 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  45.05 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  43.45 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  44.85 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  42.36 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>