More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4596 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1437  fumarate hydratase  71.33 
 
 		 477 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4596  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  935    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  53.16 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  52.52 
 
 		 544 aa  502  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  54.19 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  53.96 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  53.28 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  53.96 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  498  1e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 463 aa  498  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3621  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  52.81 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  52.72 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  52.09 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  51.86 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 466 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  54.05 
 
 		 475 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  52.74 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  52.52 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  48.81 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  52.95 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  52.3 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  52.6 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  50.22 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.28 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 631 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.65 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  53.04 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.3 
 
 		 474 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51.65 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 466 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 465 aa  458  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  52.3 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  51.31 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  48.7 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  53.61 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  50.76 
 
 		 467 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.86 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  52.75 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  51.43 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  47.72 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  50.76 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  52.08 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  50.11 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  48.81 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5517  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985388  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>