More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1437 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4596  fumarate hydratase  71.33 
 
 		 463 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1437  fumarate hydratase  100 
 
 		 477 aa  963    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703608 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.44 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3621  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572718  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  49.89 
 
 		 544 aa  472  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  51.73 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  52.55 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  53.66 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  52.11 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  51.55 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  50 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  50.78 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  52.32 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  49.35 
 
 		 492 aa  465  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  47.61 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  49.24 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  48.6 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  48.69 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5517  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985388  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  47.46 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  51.3 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.55 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  51.88 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.55 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  51.08 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  49.89 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  49.56 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  49.56 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  51.86 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  46.93 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  48.35 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  47.58 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  47.82 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  49.13 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  48.92 
 
 		 469 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  49.22 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  45.33 
 
 		 469 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  47.82 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  49 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  46.07 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  46.61 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  45.85 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  48.78 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 631 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  47.93 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  47.61 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 466 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  52.43 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  48.06 
 
 		 468 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  46.53 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  47.6 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  47.38 
 
 		 465 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  46.07 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  45.86 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  48.32 
 
 		 482 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  47.6 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  47.6 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  47.38 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  47.6 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  49.67 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  45.73 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  44.62 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  46.52 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>