More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5517 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5517  fumarate hydratase  100 
 
 		 468 aa  956    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  59.74 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  61.3 
 
 		 475 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  61.77 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  58.49 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  57.11 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  61.42 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  56.04 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  60.89 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 631 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 461 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  57.39 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 461 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  55.82 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  57.87 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  60.04 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  56.86 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  57.87 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  58.37 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 465 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  56.98 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  57.77 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  55.92 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  55.43 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  56.54 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  59.82 
 
 		 469 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  56.95 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  56.37 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.41 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  57.49 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  58.87 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  55.04 
 
 		 544 aa  514  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  58.17 
 
 		 465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  57.05 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  57.84 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  56.83 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  58.42 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  58.86 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  55.85 
 
 		 465 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  57.21 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  58.17 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  56.76 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  55.83 
 
 		 468 aa  512  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  55.83 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  58.54 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  57.59 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  55.19 
 
 		 467 aa  511  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  56.1 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  54.53 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 465 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 459 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  56.73 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  58.31 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  56.73 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  58.33 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  59.45 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  54.67 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  54.67 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  54.08 
 
 		 492 aa  508  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  54.67 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  56.73 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  54.67 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  57.65 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  53.63 
 
 		 513 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 463 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  57.62 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  54.67 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  54.89 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  55.41 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>