More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1449 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  68.68 
 
 		 468 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  99.61 
 
 		 513 aa  1054    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  100 
 
 		 513 aa  1059    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  61.62 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 459 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 468 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  56.41 
 
 		 631 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 465 aa  539  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  55.31 
 
 		 465 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  55.04 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  56.09 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  56.83 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  56.89 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  55.12 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  56.36 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  55.7 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 462 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  55.12 
 
 		 466 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 462 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  54.59 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  56.22 
 
 		 498 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 462 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  54.59 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  54.68 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  54.63 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 462 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  54.86 
 
 		 544 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  56.21 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  57.24 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  55.46 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  54.03 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  52.18 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  57.46 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  54.13 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  54.13 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 466 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  57.17 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  56.21 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  56.14 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  54.66 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  54.82 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  55.38 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>