More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2760 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4814  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 
292 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2721  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.86 
 
 
293 aa  408  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4721  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.21 
 
 
302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.11 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.71 
 
 
290 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.44 
 
 
296 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.74 
 
 
292 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.56 
 
 
287 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 
289 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.01 
 
 
290 aa  391  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 
289 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.08 
 
 
296 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
287 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
296 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0123  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.29 
 
 
291 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
310 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
293 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
293 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
289 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
293 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.48 
 
 
296 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.19 
 
 
289 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0208  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.6 
 
 
287 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1565  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
292 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
294 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
293 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
291 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  60.55 
 
 
289 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
289 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
289 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
289 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
286 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
289 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
293 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  59.52 
 
 
295 aa  374  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 
288 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
291 aa  374  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.92 
 
 
292 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
292 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.78 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 
293 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.03 
 
 
289 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1574  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
292 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
293 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
292 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
291 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  61.84 
 
 
304 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1190  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
294 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
307 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
297 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.56 
 
 
291 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.56 
 
 
292 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
292 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.19 
 
 
293 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
293 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.13 
 
 
289 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.78 
 
 
298 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.09 
 
 
289 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.56 
 
 
309 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.7 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
298 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.78 
 
 
286 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
290 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 
292 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
293 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.68 
 
 
287 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
292 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  60.07 
 
 
292 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
294 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
295 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0434  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.78 
 
 
287 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.824963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
294 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
294 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.19 
 
 
288 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
292 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
305 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.99 
 
 
297 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 
292 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.31 
 
 
297 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0279  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.53 
 
 
309 aa  364  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.643202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
294 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
305 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.13 
 
 
293 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.349025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>